Управление Институтом осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации и Уставом.
Коллегиальными органами управления АОУ ВО ДПО «Вологодский институт развития образования» являются:
Конференция работников Института является представительным органом работников. Полномочия конференции работников Учреждения регламентируются Трудовым кодексом Российской Федерации, как полномочия представительного органа работников.
Ученый совет является выборным представительным органом самоуправления Института. В состав Ученого совета входят ректор, который является его председателем, проректоры. Другие члены Ученого совета избираются на конференции работников Учреждения путем тайного голосования. Свою работу Ученый совет проводит в порядке, определяемом положением об Ученом совете.
Совет обучающихся Институра является представительным органом обучающихся. Полномочия, порядок избрания, срок полномочий членов Совета обучающихся, порядок принятия решений Советом обучающихся определяются Положением о Совете обучающихся.